Einfache Antwort: Durch Ausprobieren oder durch Erfahrung/Wissen. Wobei das eine wohl das andere nach sich zieht.

Kompliziertere Antwort:
Viele der Prozesse die gleich nach dem Hochfahren laufen sind für die ordnungsgemäße Funktion des Systems erforderlich; du willst sie nicht stillegen, sonst ist dein System nur noch eingeschränkt oder überhaupt nicht mehr brauchbar. Als erstes solltest du deshalb dein Default-Runlevel prüfen und evtl. zurückstufen (Beispiel: Ein Webserver benötigt nicht unbedingt ein hochgefahrenes Grafiksystem, also von RL 5 auf 3 zurückgehen; 2 ist irrelevant weil dann das Netzwerk fehlt.) und danach kannst du im Runlevel-Editor schauen welche Dienste mit hochgefahren werden von denen du definitiv weißt daß du sie nicht brauchst. Bei allen anderen, dir unbekannten Diensten solltest du zuerst recherchieren (in Manpages, /usr/doc/ oder per Websuche) was sie überhaupt machen bevor du sie rausschmeißt – du mußt also dein System und seine Dienste erstmal kennenlernen. Der Rest ist Erfahrung und Ausprobieren; es gibt immer ein paar Schräubchen an denen man drehen kann.

Übrigens: Ein paar detailliertere Angaben zu deinem System könnten durchaus hilfreich sein dir detailliertere Tips zu geben.